association analysis of loci controlling some important morphological trait of tobacco using aflp markers under osmotic stress condition

[ ' i d e n t i f i c a t i o n o f q u a n t i t a t i v e t r a i t l o c i i s o n e o f t h e i m p o r t a n t i s s u e s i n b r e e d i n g p r o g r a m e s p e c i a l l y u n d e r s t r e s s c o n d i t i o n . p l a n t m a t e r i a l i n t h e p r e s e n t s t u d y w a s a n a t u r a l p o p u l a t i o n i n c l u d i n g 7 2 t o b a c c o g e n o t y p e s . i n o r d e r t o a p p l y o s m o t i c s t r e s s ' , ' m a n n i t o l w i t h 0 . 3 3 m o l a r c o n c e n t r a t i o n s w a s u s e d . t h e g e n o t y p i n g o f i n d i v i d u a l w e r e p e r f o r m e d u s i n g 2 1 o u t o f 3 5 p r i m e r c o m b i n a t i o n s o f a f l p m a r k e r s . a f t e r m e a s u r i n g o f e i g h t t r a i t s i n c l u d i n g t o t a l d r y w e i g h t ' , ' d r y w e i g h t o f s h o o t ' , ' d r y w e i g h t o f l e a v e s ' , ' l e n g t h o f h i g h e s t r o o t ' , ' t o t a l d r y w e i g h t o f r o o t ' , ' l e n g t h o f l o n g e s t l e a f ' , ' l e n g t h o f l o n g e s t s t e m a n d d r y w e i g h t o f r o o t t o d r y w e i g h t o f s h o o t r a t i o ' , ' i n o r d e r t o p e r f o r m a s s o c i a t i o n a n a l y s i s a n d i d e n t i f y l i n k e d m a r k e r s c o n t r o l l i n g l o c i f i v e s t a t i s t i c a l m o d e l s w e r e u s e d b y t a s s e l s o f t w a r e . t h e s e m o d e l s w e r e g l m a n d m l m u s i n g d a t a s e t o f p h e n o t y p e a n d g e n o t y p e d a t a ' , ' p o p u l a t i o n s t r u c t u r e d a t a ( q ) ' , ' p r i n c i p l e c o m p o n e n t s ( p c ) a n d k i n s h i p d a t a d e r i v e d f r o m g e n e r a l s i m i l a r i t y i n g e n e t i c b a c k g r o u n d a r i s i n g f r o m s h a r e d k i n s h i p ( k ) . f o r a l l e i g h t t r a i t s c o m m o n i n a l l m o d e l s a n d t h e m a r k e r s w i t h e x p l a n a t i o n o f t h e m o s t p h e n o t y p e v a r i a t i o n s w e r e i d e n t i f i e d a n d d i s c u s s e d . f o r p l a n t t o t a l d r y w e i g h t e 1 1 0 ' , ' m 1 6 0 ' , 3 , ' f o r r o o t d r y w e i g h t e 0 8 0 ' , ' m 1 5 0 ' , ' 4 a n d f o r d r y w e i g h t o f s h o o t e 0 8 0 ' , ' m 1 4 0 ' , ' 2 3 w i t h t h e h i g h e s t c o e f f i c i e n t o f d e t e r m i n a t i o n ( 1 9 . 9 ' , ' 2 3 a n d 1 4 . 9 % r e s p e c t i v e l y ) w e r e i d e n t i f i e d a s t h e m o s t i m p o r t a n t m a r k e r s . i n t o t a l ' , ' t h e n u m b e r s o f i d e n t i f i e d m a r k e r s b y g l m w e r e m o r e t h a n m l m m o d e l . c o n s i d e r i n g t h e r e s u l t s ' , ' i t w i l l b e e x p e c t e d t h a t d e t e c t e d a f l p m a r k e r s i n t h e p r e s e n t s t u d y c a n b e u s e d i n m a r k e r a s s i s t e d s e l e c t i o n p r o g r a m s a f t e r c o n f i r m a t i o n a n d s p e c i f i c a t i o n b e i n g s p e c i f i e d w i t h h i g h c o n f i d e n c e . ' ]